টিস্যু কালচার প্রক্রিয়ায় পরিপক্ক অথবা অপরিপক্ক বন্ধ্যাভ্রুণ থেকে চারা উৎপাদনের প্রক্রিয়াকে এমব্রায়ো কালচার বলে। বীজের সুপ্তাবস্থা ভাঙ্গন কিংবা প্রজননশীল উদ্ভিদ উৎপাদনের জন্য এমব্রায়ো কালচার করা হয়। এ পদ্ধতিতে পেঁপে, বেগুন ও বেলের চারা উৎপাদন করা হয়েছে।