যে বন্ধনী দ্বারা অ্যামাইনো এসিড যুক্ত হয়ে প্রোটিন গঠন করে তাকে পেপটাইড বন্ধনী বলে।
১। ডাইপেপটাইড বন্ধনী (Dipeptide bond)ঃ যে পেপটাইড বন্ধনী দুইটি অ্যামাইনো এসিডকে যুক্ত করে তাকে ডাইপেপটাইড বন্ধনী বলে।
২। ট্রাইপেপটাইড বন্ধনী (Tripeptide bond)ঃ যে পেপটাইড বন্ধনী তিনটি অ্যামাইনো এসিডকে যুক্ত করে তাকে ট্রাইপেপটাইড বন্ধনী বলে।
৩। অলিগোপেপটাইড বন্ধনী (Oligopeptide bond) ঃ যে পেপটাইড বন্ধনী কয়েকটি (৪-১০) অ্যামাইনো এসিডকে যুক্ত করে তাকে অলিগোপেপটাইড বন্ধনী বলে।
৪। পলিপেপটাইড বন্ধনী (Polypeptide bond) ঃ যে পেপটাইড বন্ধনী অনেকগুলো (৫০) অ্যামাইনো এসিডকে যুক্ত করে তাকে পলিপেপটাইড বন্ধনী বলে।