জীবদেহের প্রায় সর্বত্র প্রোটিন বিরাজমান। জীবদেহের শুষ্ক ওজনের ৫০% হলো প্রোটিন। জীবদেহের সব অঙ্গে গাঠনিক বস্তু হিসেবে প্রোটিন থাকে। সব এনজাইম প্রোটিন কিন্তু সব প্রোটিন এনজাইম নয়। জৈব ক্রিয়া-বিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণকারী এনজাইম, হরমোন, অ্যান্টিবায়োটিক প্রভৃতি হলো বিশেষ ধরনের প্রোটিন। সকল উদ্ভিদ এবং প্রাণীতে প্রোটিন থাকে। ভাইরাস, ব্যাকটেরিয়া, নীলাভ সবুজ শৈবাল, শৈবাল, ছত্রাক, লাইকেন প্রভৃতিতে প্রোটিন বিদ্যমান।