১। মাটির উর্বরতা বৃদ্ধিঃ ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদ ও প্রাণীর মৃতদেহকে পচিয়ে মাটির সাথে মিশিয়ে দেয়। ফলে মাটির জৈব উপাদান বেড়ে যায় এবং উর্বরতা বৃদ্ধি পায়।
২। নাইট্রোজেন সংবন্ধনঃ Azotobacter, Pseudomonas, Clostridium প্রভৃতি ব্যাকটেরিয়া বায়ু থেকে নাইট্রোজেন ধরে মাটির সাথে মিশিয়ে দেয়। Rhizobium শিম জাতীয় উদ্ভিদের মূলে বায়ু থেকে নাইট্রোজেন সংবন্ধন করে। বর্তমানে Rhizobium-কে জীবাণু সার হিসেবে ব্যবহার করা হচ্ছে। মসুর ডালের মূলে Rhizobium এর তিনটি প্রজাতি নডিউল সৃষ্টি করে। এগুলো হলো- Rhizobium bangladashense, Rhizobium bine এবং Rhizobium lentis। বাংলাদেশী বিজ্ঞানী ড. হারুন অর রশিদ এই তিনটি প্রজাতি আবিষ্কার করেছেন।
৩। নাইট্রিফিকেশনঃ নাইট্রিফিকেশন প্রক্রিয়ায় নাইট্রিফাইং ব্যাকটেরিয়ার প্রভাবে অ্যামোনিয়া থেকে নাইট্রাইট উৎপন্ন হয়। পরে নাইট্রাইট থেকে নাইট্রেট উৎপন্ন হয়। নাইট্রেট মাটির উর্বরতা বৃদ্ধি করে।
৪। পতঙ্গ নাশক হিসেবেঃ কোন কোন ব্যাকটেরিয়া জমিতে পতঙ্গ নাশক হিসেবে ব্যবহার হয়। যেমন- Bacillus thuringiensis।
৫। ফলন বৃদ্ধিতেঃ কিছু ব্যাকটেরিয়া জমিতে প্রয়োগ করে ধানের ফলন ৩১.৮% এবং গমের ফলন ২০.৮% বৃদ্ধি করা সম্ভব হয়েছে।
৬। ফসলের উন্নত জাত সৃষ্টিঃ ব্যাকটেরিয়ার সাহায্যে জিনের স্থানান্তর ঘটিয়ে ট্রান্সজেনিক ফসল সৃষ্টি করা হয়েছে। এসব ট্রান্সজেনিক ফসল উন্নত মানের।
৭। জৈব সার উৎপাদনঃ বর্তমানে ব্যাকটেরিয়ার সাহায্যে গোবর ও ময়লা আবর্জনা পচিয়ে জৈব সার তৈরী করা হচ্ছে। জমিতে রাসায়নিক সারের পরিবর্তে জৈব সার ব্যবহার হচ্ছে।
৮। পশুখাদ্য বা সিলেজ তৈরীঃ ধানের খড়, ঘাস এবং লিগিউম জাতীয় উদ্ভিদের কান্ড কেটে টুকরা টুকরা করা হয়। টুকরা গুলো চিটাগুড়ের সাথে মিশিয়ে আবদ্ধ পাত্রে রাখা হয়। গাঁজন প্রক্রিয়ায় Lactobacillus ব্যাকটেরিয়া এগুলোকে উন্নতমানের গো-খাদ্যে পরিনত করে। এই গো-খাদ্যকে সিলেজ বলে।
৯। পাট শিল্পেঃ Clostridium butricum জাতীয় ব্যাকটেরিয়ার সাহায্যে পাট পচিয়ে আঁশ পৃথক করা হয়।
১০। সেলুলোজ পরিপাকঃ গবাদিপশুর পাকস্থলীতে Ruminococcus albus ও Ruminococcus flavefaciens ব্যাকটেরিয়া বাস করে। এ সব ব্যাকটেরিয়া সেলুলেজ এনজাইম উৎপন্ন করে। সেলুলেজ এনজাইম কাঁচা ঘাস ও উদ্ভিদ হজমে সাহায্য করে।