যে এনজাইম ব্যবহার করে DNA হতে নির্দিষ্ট অংশ কেটে নেয়া হয় তাকে রেস্ট্রিকশন এনজাইম বা RE বলে। রেস্ট্রিকশন এনজাইমকে আণবিক কাঁচি বা জৈবিক ছুরি (Biological Knife) বলা হয়। রেস্ট্রিকশন এনজাইম দিয়ে DNA অণু কাটলে দুইটি প্রান্তদেশ তৈরী হয়। একটিব্লান্ট প্রান্ত এবং অপরটি স্টিকি প্রান্ত। ব্যাকটেরিয়া থেকে প্রায় ২৫০ রকমের রেস্ট্রিকশন এনজাইম পাওয়া গিয়েছে। বিজ্ঞানী হামিল্টন স্মিত (Hamilton Smith) এবং তাঁর সহযোগীরা (১৯৭০) রেস্ট্রিকশন এনজাইম আবিষ্কার করেন।