ভ্রুণথলীর প্রধান অংশ তিনটি। এগুলো হলো–
১। গর্ভযন্ত্র (Egg apparatus)ঃ ভ্রুণথলীর ডিম্বকরন্ধ্রের নিকটের তিনটি কোষকে একত্রে গর্ভযন্ত্র বলে। এদের মধ্যে মাঝখানের বড় কোষটিকে ডিম্বাণু এবং দুই পাশের ছোট কোষ দুটিকে সহকারী কোষ বলে।
২। প্রদিপাদ কোষ (Antipodal cell)ঃ ভ্রুণথলীর ডিম্বকমূলের দিকের তিনটি কোষকে একত্রে প্রতিপাদ কোষ বলে।
৩। সেকেন্ডারী নিউক্লিয়াস (Secondary nucleus)ঃ দুই মেরু থেকে দুইটি নিউক্লিয়াস ভ্রুণথলীর মাঝখানে আসে। এরপর নিউক্লিয়াস দুটি মিলিত হয়ে সেকেন্ডারী নিউক্লিয়াস গঠন করে।