প্রি- mRNA-তে স্পাইসিং-এর পর exon গুলো পুনঃসংযাজিত হয়ে DNA সিকোয়েন্স থেকে একই জিন বিভিন্ন mRNA তৈরী করতে পারে। এই প্রক্রিয়াকে অল্টারনেটিভ স্প্লাইসিং বলে। এই প্রক্রিয়ায় একই জিন থেকে বিভিন্ন ধরনের বৈচিত্র্যময় প্রোটিন তৈরী হয়। অল্টারনেটিভ স্প্লাইসিং-এর কারণে মানবদেহে ২০,০০০ জিন থেকে ১,০০,০০০ প্রকার প্রোটিন তৈরী হয়।