পলিপেপটাইড শৃঙ্খলের ভিত্তিতে প্রোটিন বিভিন্ন ধরনের।
(i) মনোমেরিক প্রোটিন (Monomeric protein) ঃ যে প্রোটিন একটি পলিপেপটাইড শৃঙ্খল দ্বারা গঠিত তাকে মনোমেরিক প্রোটিন বলে। যেমন- মায়োগ্লোবিন।
(ii) ডাইমেরিক প্রোটিন (Dimeric protein) ঃ যে প্রোটিন দুইটি পলিপেপটাইড শৃঙ্খল দ্বারা গঠিত তাকে ডাইমেরিক প্রোটিন বলে। যেমন- ট্রান্সঅ্যামাইলেজ।
(iii) ট্রাইমেরিক প্রোটিন (Trimeric protein) ঃ যে প্রোটিন তিনটি পলিপেপটাইড শৃঙ্খল দ্বারা গঠিত তাকে ট্রাইমেরিক প্রোটিন বলে। যেমন- হিমেরিথ্রিন।
(iv) টেট্রামেরিক প্রোটিন (Tetrameric protein) ঃ যে প্রোটিন চারটি পলিপেপটাইড শৃঙ্খল দ্বারা গঠিত তাকে টেট্রামেরিক প্রোটিন বলে। যেমন- হিমোগ্লোবিন।
(v) পলিমেরিক প্রোটিন (Polymeric protein) ঃ যে প্রোটিন কয়েকটি পলিপেপটাইড শৃঙ্খল দ্বারা গঠিত তাকে পলিমেরিক প্রোটিন বলে। যেমন- ইনসুলিন।