যে এনজাইম প্রোটিনকে ভেঙ্গে অ্যামাইনো এসিডে পরিনত করে তাকে প্রোটিয়েজ বলে। প্রোটিন ভাঙ্গার প্রক্রিয়াকে প্রোটিওলাইসিস বলে। একে প্রোটিওলাইটিক বা সিস্টেমিক এনজাইমও বলা হয়। প্রোটিয়েজ এনজাইম প্রোটিন জাতীয় খাদ্যকে পরিপাক করে। যেমন- পেপসিন, ট্রিপসিন, ইরেপসিন, প্যাপেইন ইত্যাদি। প্রোটিয়েজের ব্যবহার বা গুরুত্ব হলো-
(i) পাউরুটির গুণগত মান উন্নয়নে প্রোটিয়েজ এনজাইম ব্যবহার হয়।
(ii) রক্ত তঞ্চন নিয়ন্ত্রণে ইহা ব্যবহার হয়।
(iii) ওষুধ তৈরীতে এর ব্যবহার রয়েছে।
(iv) ইহা প্রাণির মৃতদেহকে ভেঙ্গে পরিবেশে নাইট্রোজেন ও কার্বন মুক্ত করে।
(v) জীববিজ্ঞানের গবেষণায় প্রোটিয়েজ এনজাইম ব্যবহার হয়।